Beyni destekleyen bir çok durumun bağırsaklardan kaynaklandığı söylenir. Hatta bağırsaklar için ikinci beyin de denmektedir. Sızdıran bağırsak sendromu çoğunlukla bağırsak limenün geçirgenliğinde gerçekleşmiş artışı tanımlar. GAPS diyeti ile glüten büsbütün beslenme nizamından çıkarılır. Ayrıyeten probiyotik ve prebiyotikler beslenme tüketiminin içine rutin olarak eklenir. Sızıntılı bir bağırsağa katkı sağlaması mümkün durumların önüne geçilmesi hedeflenmektedir.
Yukarıda sayılanlara ek olarak aşağıdaki ruhsal sorunlarda de bu diyetin uygulanmasında çeşitli yararlar olduğu bilinmektedir:
GAPS diyetinde temel kural bağırsakların zora girmemesidir. Yapay olan besinlerin hepsi bağırsakları zorlar. Bunlardan kurtulan bağırsaklar sıhhatine kavuşur. Bu diyette bağırsakları zorlamayan ve tüketilmesi önerilen besinler şu biçimdedir:
Disiplin isteyen bir diyettir. Lakin başarılı sonuçlar alınır ve sonraki yıllar için yatırım niteliğindedir. Çocuklarda daha çabuk düzgünleşme görülmesini sağlar. Yaklaşık 2 yıllık bir süreçtir. Sindirim sisteminin bir kez sağlıklı bir formda çalışması sağlandığı vakit bütün besinlerden kademeli olarak tüketilmesinde sakınca yoktur.